I. Direcția teologie-filologie-istorie-științele comunicării TeoFil: Programul TeoFil are ca obiectiv traducerea și editarea de:
- texte fundamentale ale teologiei catolice, spiritualității și literaturii medievale în ediții critice,
- instrumente de lucru (dicționar teologic)
- documente istorice și surse diplomatice privitoare la istoria catolicismului în țările române (Fontes Historiae Catholicorum Romaniae)
- volume de autor (monografii, culegeri de studii)
Alături de realizarea colecțiilor de ediții critice, surse și instrumente de lucru, programul are ca obiectiv și alcătuirea unor baze de date, care să devină resurse pentru cercetătorii din domeniile amintite. TeoFil găzduiește de asemenea o reflecție, pe baza teoriilor traducerii și a teoriilor comunicării, asupra inculturării terminologiei catolice și creștine în cadrele lingvistice și culturale românești.
II. Direcția teologie-sociologie, antropologie, științe politice TeoSoc: Programul TeoSoc reunește cadre didactice, cercetători și doctoranzi din domeniile afiliate științelor sociale, în relația lor cu teologia. În cadrul TeoSoc, funcționează în prezent echipa proiectului internațional The Concept of Love and Its Meanings in Mystical-Theological, Literary and Philosophical Contexts, promovat de Universitatea din București, România, de Fundación Idente de Estudios e Investigación, Berlin, Germania, de Universitatea din Viena, Austria și de Council for Research on Values and Philosophy (Washington DC). La acest proiect internațional, coordonatorul echipei de cercetare din România este decanul FTC, iar membrii sunt parte a corpului didactic al FTC, alături de alți zece cercetători și profesori de la universități românești și internaționale. Proiectul, care se va finaliza cu două volume de studii urmărește uzul și abuzul unui concept antropologic fundamental în societățile contemporane, consecințele culturale ale acestora și schimbările produse în experiența religioasă a credincioșilor din Biserică și din afara ei. Perspectiva interdisciplinare creează cadrul unei confruntări a diverselor metode de analiză a normelor și practicilor religioase în societatea contemporană, oferite de teologie și de filosofie și de disciplinele din sfera științelor sociale. Conferințele și dezbaterile asociate acestui proiect vor relansa interesul pentru explorarea integratoare a căutării sensului iubirii în epoca globalizării, în cadrele culturale ale unor pluralități religioase.
În al doilea rând, programul TeoSoc este menit să revitalizeze dezbaterea în jurul actualității doctrinei sociale a Bisericii, a capacității ei de a răspunde la provocările crizei economice, politice și antropologice ce traversează societățile democratice.
În al treilea rând, TeoSoc are misiunea de a asigura o dimensiune ecumenică acestei reflecții, prin cooptarea unor specialiști din câmpul teologiei ortodoxe și reformate, precum și a unor sociologi sau politiști poziționați neutru din punct de vedere confesional.
III. Direcția teologie-filosofie scolastică, filosofia religiilor TeoTomA: Programul TeoTomA este articulat la un grup mare de cercetători atașat studiilor tomiste și promovării lor în România. Aceștia sunt membrii ai SITA (Societatea Internațională Toma de Aquino). Principalul obiectiv SITA este organizarea anuală a unei conferințe în România, cu participare internațională, potrivit unei tematici menite să pună în evidență actualitatea sistemului făurit de Sfântul Toma de Aquino și pertinența acestuia în înțelegerea problematicii și provocărilor modernității și postmodernității.
Pornind de la studiul unor autori care au influențat gândirea lui Toma de Aquino, direcția TeoTomA urmărește un dialog structurat între teologie și filosofia creștină, între teologie și filosofia religiilor, centrat pe reflecția comună asupra conceptelor și temelor transdisciplinare.
IV. Direcția de studii biblice TeoBiblia își propune să aprofundeze textele biblice și parabiblice (scrierile biblice vechi necanonice) pentru a percepe mai bine contextul care a generat Cuvântul Sfintei Scripturi, mesajul pe care îl transmite și actualitatea Lui. În acest sens angajează cadrele didactice, masteranzii și doctoranzii Facultății într-un efort creativ, efort la care sunt invitați și specialiști din domenii precum cel biblic, teologic, istoric, filologic, lingvistic, etc, ale altor structuri de învățământ și de cercetare din cadrul Universității din București sau din alte instituții din țară și de peste hotare. Roadele acestor cercetări vor fi publicate în revista Facultății. De asemenea, să popularizeze mesajul biblic (potrivit Dei Verbum, Verbum Domini, Interpretarea Bibliei în Biserică) prin intermediul publicațiilor pe care la avem la dispoziție (Editura Universității București, Editura ARCB, reviste precum Actualitatea Creștină) și prin organizarea pentru un public cât mai larg de Lectio Divina ori de Cursuri de inițiere bibilică prin Școala biblică.
V. Direcția patristică TeoPatrum – se va ocupa cu cercetarea și studiul Sfinților Părinți ai Bisericii, orientali și occidentali; principalul obiectiv va fi acela de a promova gândirea lor teologică în scrierile lor, care au stat la baza cristalizării dogmelor creștine și a disciplinei bisericești; trăind într-un context religios în care cele două tradiții ale Bisericii, bizantină și latină, conviețuiesc este important să cunoaştem și să promovăm gândirea Părinților Bisericii și a Scriitorilor bisericești care au contribuit decisiv la zidirea Bisericii lui Cristos – Una – Sfântă – Catolică – Apostolică, așa cum este ea mărturisită de Simbolul credinței de la Niceea, promulgat și adoptat în Biserica universală, în anul 325.